SRPS EN ISO 23418:2022

Микробиологија ланца хране – Секвенцирање целог генома за типизацију и геномску карактеризацију бактерија – Општи захтеви и смернице

Microbiology of the food chain - Whole genome sequencing for typing and genomic characterization of bacteria - General requirements and guidance (ISO 23418:2022)

Апстракт

Овим међународним стандардом утврђују се минимални захтеви за генерисање и анализу података о секвенцирању целог генома (WGS) добијених за бактеријe присутне у храни. Ти захтеви су применљиви на било коју платформу или хемијски поступак за секвенцирање. Овај процес може обухватати следеће фазе:
a) руковање бактеријским културама;
b) изолација геномске DNK;
c) припрема библиотеке за секвенцирање, секвенцирање и процена квалитета очитаних секвенци нативне DNK и њиховог складиштења;
d) биодинформатичка анализа, укључујући методе као што је анализа једнонуклеотидних полиморфизама високог квалитета (hqSNP), генотипизација мулти-локуса у језгру генома (геному специфичном за врсту) и комплетног појединачног генома (cgMLST, wgMLST), и биодинамичка валидација протока информација;
e) прикупљање метаподатака и депоновање у секвенцијалне базе података.

Повезане директиве

НАПОМЕНА: Уколико се у пољу са називом директиве не налази реч „хармонизован“ (обележена зеленом бојом), то значи да европски стандард није цитиран у OJEU.